Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efhc2Q9D485 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms