Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trappc6bQ9D289 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trappc6bQ9D289 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trappc6bQ9D289 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trappc6bQ9D289 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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