Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms