Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms