Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1aQ9D132 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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