Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms