Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shisa9Q9CZN4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms