Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms