Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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