Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms