Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tdrd12Q9CWU0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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