Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6kQ9CWP4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms