Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930519P11RikQ9CUJ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms