Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldnd1Q9CQX5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd1Q9CQX5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd1Q9CQX5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldnd1Q9CQX5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms