Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms