Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms