Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb1Q9CPU1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms