Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bhlhe41Q99PV5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms