Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Smim3Q99PE5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms