Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rassf3Q99P51 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms