Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnpo2Q99LG2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms