Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms