Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdcbp2Q99JZ0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms