Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms