Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms