Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms