Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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