Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms