Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms