Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms