Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx11Q91WL6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx11Q91WL6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx11Q91WL6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx11Q91WL6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx11Q91WL6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx11Q91WL6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx11Q91WL6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx11Q91WL6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Snx11Q91WL6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx11Q91WL6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx11Q91WL6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx11Q91WL6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx11Q91WL6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx11Q91WL6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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