Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Smg8Q8VE18 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg8Q8VE18 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms