Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Stx18Q8VDS8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx18Q8VDS8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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