Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms