Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms