Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms