Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms