Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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