Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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