Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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