Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp27Q8CEG8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp27Q8CEG8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp27Q8CEG8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp27Q8CEG8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp27Q8CEG8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp27Q8CEG8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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