Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms