Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4930507D05RikQ8C9C9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms