Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms