Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nlrp4bQ8C6J9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nlrp4bQ8C6J9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms