Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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