Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ctdsp2Q8BX07 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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