Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms