Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prpf18Q8BM39 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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