Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarsl2Q8BLY2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tarsl2Q8BLY2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tarsl2Q8BLY2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms